Ministerstvo zdravotnictví upozorňuje, že ke dni 29.6.2009 byl ukončen provoz rekreace v Brněnské přehradě – z důvodu čištění nádrže a jejího dna byla snížena hladina vody v nádrži na minimum. Zákaz vstupu do nádrže se předpokládá po celou letní rekreační sezonu 2009. V místech ovlivněných povodněmi je nutné očekávat zhoršenou kvalitu vody, zvýšené riziko nákazou infekčním či jiným onemocněním a z preventivních důvodů se nedoporučuje v těchto lokalitách koupání. V některých nádržích jsou už nebezpečné sinice. Sinice obsahují látky, které způsobují alergie. U koupajícího se člověka, podle toho, jak je citlivý a jak dlouho ve vodě pobývá, se mohou objevit vyrážky, zarudlé oči, rýma. Alergické reakce mohou vyvolat i některé řasy. Sinice také mohou produkovat různé toxiny!