Podle Ministerstva zdravotnictví je v místech ovlivněných povodněmi nutné očekávat zhoršenou kvalitu vody, zvýšené riziko nákazou infekčním či jiným onemocněním a z preventivních důvodů se nedoporučuje v těchto lokalitách koupání. Voda neodpovídá hygienickým požadavkům v přehradách Orlík a Hostivař. Pro uživatele představuje zdravotní riziko, koupání nelze doporučit zejména pro děti, těhotné ženy, osoby trpící alergií a osoby s oslabeným imunitním systémem. Zákaz koupání je v koupališti Peklo na Vysočině a v přehradě Luhačovice. Zde hrozí akutní poškození zdraví!